Le paradigme traditionnel de diagnostic des patients atteints de MHM repose sur la quantification de classes spécifiques de métabolites dans l’urine, le plasma, le liquide céphalorachidien ou autres liquides biologiques. Des concentrations modifiées de métabolites ou des métabolites anormaux indiquent une déficience d’enzymes, de transporteurs ou de chaperons spécifiques. Bien que cette approche ait fait ses preuves, elle présente l’inconvénient de nécessiter une hypothèse a priori sur les voies biochimiques affectées, d’exiger l’utilisation de plusieurs tests, ce qui demande beaucoup de temps et de travail, et d’avoir une couverture limitée alors qu’une large couverture est nécessaire pour l’intégration avec d’autres données omiques, comme le séquençage de l’exome entier.

À mesure de découvrir de nouvelles maladies pour lesquelles nous ne disposons pas nécessairement de biomarqueurs biochimiques appropriés, cette approche devient de plus en plus insuffisante. Parallèlement, les progrès récents de la spectrométrie de masse ont ouvert la voie à une nouvelle approche diagnostique. L’analyse du métabolome complet à l’aide de la métabolomique non ciblée dans un cadre diagnostique offre de nombreuses possibilités en tant que premier test de dépistage, mais aussi pour vérifier la pathogénicité des variants génétiques détectés par le séquençage de l’exome et comme approche supplémentaire chez les patients qui sont restés non diagnostiqués après une longue odyssée diagnostique. De nombreux efforts sont actuellement déployés pour valider et mettre en œuvre ces approches dans des contextes cliniques afin d’améliorer le potentiel, la précision et la rapidité du diagnostic.

La métabolomique est l’étude complète des métabolites dans les tissus, les cellules et les biofluides, tels que le plasma, le sérum et l’urine ou tout autres échantillon biologique.